17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5273 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  811    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  31.16 
 
 
411 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  29.68 
 
 
410 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0738  hypothetical protein  31.15 
 
 
343 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195343  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  28.95 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0392  hypothetical protein  29.73 
 
 
369 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000404555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  38.1 
 
 
286 aa  53.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  30.46 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  28.12 
 
 
175 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1425  hypothetical protein  39.44 
 
 
394 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1017  hypothetical protein  38.98 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.46407e-34 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  32.76 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4237  hypothetical protein  27.13 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  36.92 
 
 
233 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  40.38 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3515  hypothetical protein  32.2 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  32.53 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>