15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2598 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  100 
 
 
286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1425  hypothetical protein  30.56 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1017  hypothetical protein  30.18 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.46407e-34 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  31.52 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3515  hypothetical protein  34.51 
 
 
381 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  38.1 
 
 
389 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  27.86 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0738  hypothetical protein  34.58 
 
 
343 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195343  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  27.2 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  35.48 
 
 
175 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  26.22 
 
 
410 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  34.48 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  36.54 
 
 
361 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0392  hypothetical protein  27.35 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000404555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4237  hypothetical protein  34.38 
 
 
356 aa  43.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>