13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1585 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  34.03 
 
 
286 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  32.64 
 
 
291 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  27.11 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  45.16 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4943  putative phage-related protein  30.95 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  29.87 
 
 
361 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  35.79 
 
 
411 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1203  hypothetical protein  27.04 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  40.3 
 
 
175 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  40.38 
 
 
409 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  40.38 
 
 
389 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  50 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>