11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3690 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  44.84 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  34.03 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  29.27 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1203  hypothetical protein  28.65 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  26.44 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  39.29 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4943  putative phage-related protein  31.21 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  39.62 
 
 		 410 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  41.51 
 
 		 411 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>