14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1003 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1203  hypothetical protein  34.07 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal  0.100552 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4943  putative phage-related protein  38.46 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  48.89 
 
 		 411 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  30.21 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  34.31 
 
 		 287 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  28.12 
 
 		 389 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  34.33 
 
 		 410 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  34.34 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  37.97 
 
 		 286 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  40.3 
 
 		 281 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 286 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0738  hypothetical protein  38.6 
 
 		 343 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195343  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0392  hypothetical protein  33.85 
 
 		 369 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000404555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>