13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2728 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  759    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4237  hypothetical protein  37.7 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  42.42 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3690  hypothetical protein  39.29 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.271759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  29.87 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  30.46 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  32.93 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  44.68 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3515  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1425  hypothetical protein  24.82 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  36.54 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1568  hypothetical protein  38.78 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.445072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>