13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3009 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3009  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  840    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1425  hypothetical protein  32.34 
 
 
394 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3515  hypothetical protein  33.33 
 
 
381 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1017  hypothetical protein  34.38 
 
 
333 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.46407e-34 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2598  HNH endonuclease  31.52 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000498075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4237  hypothetical protein  33.06 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5273  hypothetical protein  28.95 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2728  hypothetical protein  42.42 
 
 
361 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2083  hypothetical protein  41.27 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000112256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1736  hypothetical protein  36.92 
 
 
233 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.366884 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2984  hypothetical protein  39.68 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0738  hypothetical protein  40.74 
 
 
343 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195343  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1585  putative EA31 gene protein, phage lambda  40.38 
 
 
281 aa  46.6  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.983249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>