16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0494 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  29.89 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  28.34 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0627  hypothetical protein  40 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2904  hypothetical protein  34.25 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0796384  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5504  hypothetical protein  31.07 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241088  decreased coverage  0.000273581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  43.75 
 
 		 299 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  23.86 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7061  hypothetical protein  28.27 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.667269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  32.88 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02160  hypothetical protein  39.29 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  39.62 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  35.29 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2346  hypothetical protein  35.59 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2265  hypothetical protein  25.64 
 
 		 207 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.389135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  24.73 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>