14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1461 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  455  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  92.62 
 
 		 150 aa  298  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  37.67 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  33.49 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  26.73 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  26.79 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  25.84 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  28.65 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  35.63 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0882  hypothetical protein  38 
 
 		 69 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  27.47 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  26.62 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0494  hypothetical protein  24.73 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426631  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2941  hypothetical protein  24.7 
 
 		 258 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>