16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3356 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  37.67 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  41.22 
 
 
150 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  26.21 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  30.88 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  28.3 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  38.14 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  34.78 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  28.65 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2941  hypothetical protein  27.36 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0882  hypothetical protein  36.54 
 
 
69 aa  48.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  29.2 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  23.17 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3136  hypothetical protein  34.29 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  28.19 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>