13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1848 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  317  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  92.62 
 
 		 216 aa  298  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  41.22 
 
 		 209 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  37.58 
 
 		 199 aa  90.1  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  39.77 
 
 		 207 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0882  hypothetical protein  44 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  31.75 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  30.94 
 
 		 215 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  30.71 
 
 		 215 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  27.08 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  27.33 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  29.66 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2941  hypothetical protein  34.69 
 
 		 258 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>