15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3726 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3136  hypothetical protein  53.23 
 
 
206 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  42.86 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  40.18 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  28.18 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  28.7 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  31.03 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  23.93 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  30.28 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  38.14 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  29.55 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  27.08 
 
 
150 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  26.62 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  27.5 
 
 
240 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0200  hypothetical protein  25.24 
 
 
213 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>