20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0741 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0741  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1461  hypothetical protein  33.49 
 
 
216 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.57906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1848  hypothetical protein  37.58 
 
 
150 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0379  hypothetical protein  25.86 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3356  hypothetical protein  26.21 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3669  hypothetical protein  26.05 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775009  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0031  hypothetical protein  26.8 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5114  hypothetical protein  24.77 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0418  hypothetical protein  27.17 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3726  hypothetical protein  30.28 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2941  hypothetical protein  36.54 
 
 
258 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4120  hypothetical protein  32.11 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2490  hypothetical protein  28.14 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000626304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0627  hypothetical protein  28.68 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1599  hypothetical protein  29.69 
 
 
244 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0882  hypothetical protein  42.11 
 
 
69 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  27.64 
 
 
234 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  31.82 
 
 
229 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0121  hypothetical protein  37.5 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.230908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  29.17 
 
 
174 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>