13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0929 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  37.01 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  35.16 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  46.27 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  35.17 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  28.73 
 
 
769 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  26.83 
 
 
269 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  28.32 
 
 
736 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  25.45 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  31.76 
 
 
245 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 
709 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  28.46 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  31.68 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>