14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2958 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2958  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0856  hypothetical protein  35.93 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  33.53 
 
 		 769 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3597  hypothetical protein  31.79 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00139996  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  31.75 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0022  hypothetical protein  29.27 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3442  hypothetical protein  29.94 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000827494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  30.97 
 
 		 736 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1782  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4983  hypothetical protein  31.47 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0929  hypothetical protein  26.83 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0953225  normal  0.150817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4015  hypothetical protein  32.46 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6341  hypothetical protein  32.41 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0005  hypothetical protein  23.65 
 
 		 229 aa  42  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>