71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2940 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  837    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  32.06 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  32.56 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  28.77 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  31.03 
 
 		 454 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.68 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  29.74 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  29.39 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.92 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  27.64 
 
 		 422 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.41 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  26.88 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  23.77 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  42.4 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  40.8 
 
 		 422 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  35.93 
 
 		 203 aa  106  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  39.39 
 
 		 482 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  26.29 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  34.52 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  28.91 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  32.74 
 
 		 452 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  25.24 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  24.01 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  28.57 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  31.68 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  31.61 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  41.86 
 
 		 769 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.7 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  38.95 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  41.98 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.33 
 
 		 736 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  37.08 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  35.42 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  36.25 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  34.44 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  23.66 
 
 		 709 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  41.38 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  36.59 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  26.74 
 
 		 610 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  34.09 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  27.43 
 
 		 176 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  49.02 
 
 		 452 aa  53.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  46.3 
 
 		 79 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  34.27 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  35.79 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  38.46 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  23.27 
 
 		 532 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.48 
 
 		 616 aa  49.7  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  34.44 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  30.51 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  27.73 
 
 		 582 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  40.91 
 
 		 608 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.94 
 
 		 976 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  31.18 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  22.22 
 
 		 666 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  29.25 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  20.9 
 
 		 564 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  30.34 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  36.67 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  24.48 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  48.08 
 
 		 663 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  44 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  29.55 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.44 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  46.94 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  29.67 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  36.49 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000215476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1454  ATPase  31.78 
 
 		 597 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  23.2 
 
 		 588 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  36.84 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  34.43 
 
 		 1063 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>