47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1791 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  24.23 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  33.59 
 
 		 769 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  25.19 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  27.32 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  24.74 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  25.14 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  35 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  36.63 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  59.57 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  40.48 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  35.11 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  36.17 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  28.67 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  34.04 
 
 		 610 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  36 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  36.59 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  28.18 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  39.33 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  22.76 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.56 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  33.33 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  21.33 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  31.3 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  36.08 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  30.48 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  35.4 
 
 		 203 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  47.92 
 
 		 454 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  25.76 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  33.33 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  30.48 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.25 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  32.61 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  44.64 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  29.01 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  32.53 
 
 		 608 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  41.79 
 
 		 176 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  31.76 
 
 		 403 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.63 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  22.78 
 
 		 976 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  30.46 
 
 		 577 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  29.57 
 
 		 457 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  34.41 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.65 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  32.28 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  22.66 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>