154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0419 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  868    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  62.44 
 
 
422 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  42.2 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  34.03 
 
 
440 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  32.55 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  29.93 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.67 
 
 
454 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  30.68 
 
 
439 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  26.22 
 
 
423 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  25.68 
 
 
422 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  25.81 
 
 
482 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  28.63 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.56 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  25.89 
 
 
455 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  26.01 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  26.44 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  29.1 
 
 
406 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  25.57 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  27.29 
 
 
403 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  26.41 
 
 
410 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  37.82 
 
 
203 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  40.14 
 
 
478 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  31.96 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  30.98 
 
 
709 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  24.83 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  23.5 
 
 
736 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  27.37 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  23.01 
 
 
769 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  28.8 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  24.23 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  32.26 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  27.66 
 
 
577 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  25.43 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  30.28 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  24.1 
 
 
497 aa  63.9  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  42.31 
 
 
610 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.83 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0093  conserved hypothetical protein  23.01 
 
 
495 aa  56.2  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  47.17 
 
 
1074 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  23.18 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  31.53 
 
 
888 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  43.1 
 
 
890 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  53.49 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  32.26 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  44.83 
 
 
650 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  49.06 
 
 
924 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  30.48 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  48 
 
 
926 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  28.03 
 
 
532 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  26.74 
 
 
976 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  45.83 
 
 
935 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  42.31 
 
 
912 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  49.06 
 
 
895 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  41.51 
 
 
891 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  29.01 
 
 
608 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  40.62 
 
 
452 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  34.95 
 
 
368 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  26.92 
 
 
802 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  27.21 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  26.16 
 
 
371 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  46.51 
 
 
365 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.48 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  31.17 
 
 
447 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  44.19 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  47.17 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.36 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  39.22 
 
 
1060 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  31.25 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  43.18 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  45.28 
 
 
902 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  47.73 
 
 
79 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4121  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.976477  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4170  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0248786  normal  0.357156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4228  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0003  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000748335  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4064  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4048  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331316  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  27.94 
 
 
374 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  29.33 
 
 
582 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 
1189 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03583  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0003  DNA replication and repair protein RecF  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.877523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03527  hypothetical protein  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  26.28 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  26.28 
 
 
370 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5128  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.010515  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3913  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00221081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4210  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0034  recombination protein F  53.49 
 
 
361 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000927918  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0003  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0566679  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4065  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0837895  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4225  recombination protein F  51.16 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0003  DNA replication and repair protein RecF  52.5 
 
 
382 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  35.29 
 
 
1021 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  51.16 
 
 
368 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  34.78 
 
 
1063 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54192  predicted protein  40 
 
 
1099 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  35.29 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0003  recombination protein F  55 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0385213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>