46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1645 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  100 
 
 
451 aa  910    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  45.22 
 
 
450 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  45.47 
 
 
457 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  42.86 
 
 
446 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  45.63 
 
 
448 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  38.48 
 
 
423 aa  279  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  36.69 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  33.33 
 
 
443 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  30.62 
 
 
427 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  95.56 
 
 
94 aa  177  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  25.17 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  29.17 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  30.53 
 
 
455 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  39.44 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  34.48 
 
 
976 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  43.24 
 
 
452 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  41.67 
 
 
176 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  35.71 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  38.96 
 
 
532 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  33.03 
 
 
251 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  40.86 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  37.68 
 
 
457 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  30.48 
 
 
440 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  39.51 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  34.69 
 
 
595 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3044  ABC transporter related  37.78 
 
 
239 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  42.03 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.81 
 
 
533 aa  47  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  35.06 
 
 
246 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  34.09 
 
 
551 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2350  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  27.17 
 
 
334 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  39.44 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  37.8 
 
 
231 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  40 
 
 
793 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 
230 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  29.63 
 
 
458 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1962  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
238 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  30.47 
 
 
816 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.47 
 
 
334 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  37.5 
 
 
248 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2781  excinuclease ABC subunit A  28.08 
 
 
1056 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.836285  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0302  ABC transporter related  23.97 
 
 
289 aa  43.5  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.353598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  33.33 
 
 
513 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2541  excinuclease ABC, A subunit-related protein  27.4 
 
 
1056 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1482  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.35 
 
 
727 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
246 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>