14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0454 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  100 
 
 		 606 aa  1247    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  37.79 
 
 		 591 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  29.56 
 
 		 648 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  28.69 
 
 		 672 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  27.17 
 
 		 643 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0608  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1404 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  31.07 
 
 		 666 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.24 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2706  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.267773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  31.13 
 
 		 593 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  24.18 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  23.42 
 
 		 457 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  25.66 
 
 		 567 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  31.03 
 
 		 530 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>