9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0896 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0896  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1379    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.693496  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3136  hypothetical protein  34.57 
 
 
648 aa  261  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.829641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  31.11 
 
 
591 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0454  AAA ATPase  28.69 
 
 
606 aa  206  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  31.64 
 
 
643 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0608  hypothetical protein  23.47 
 
 
1404 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  25.3 
 
 
712 aa  47.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  30.12 
 
 
445 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  36.84 
 
 
530 aa  44.3  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>