45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1859 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  944    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  25 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  21.98 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1513  hypothetical protein  26.08 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  22.13 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  29.17 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  29.46 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  30 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  28.24 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7321  AAA ATPase  34.71 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  40 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  41.43 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  39.74 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  31.13 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  30.66 
 
 		 457 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  29.73 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  41.27 
 
 		 976 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  35.06 
 
 		 532 aa  50.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  27.84 
 
 		 251 aa  50.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6641  ABC transporter related  26.6 
 
 		 542 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  37.84 
 
 		 588 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  29.9 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.84 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1634  ATPase  32.58 
 
 		 94 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  26.58 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  26.19 
 
 		 541 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.68 
 
 		 281 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.82 
 
 		 230 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  37.1 
 
 		 228 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  32.05 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  30 
 
 		 647 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  30.08 
 
 		 264 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3904  dipeptide transporter ATP-binding subunit  30.77 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.463258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  27.81 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  37.04 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.05 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.68 
 
 		 278 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  32.65 
 
 		 271 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  36.23 
 
 		 252 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.21 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  22.55 
 
 		 567 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0029  ABC transporter ATP-binding protein  33.1 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  41.54 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4095  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.49 
 
 		 326 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>