More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0220 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  54.38 
 
 		 659 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  57.12 
 
 		 648 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 638 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  81.79 
 
 		 638 aa  959    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  99.19 
 
 		 636 aa  1150    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.54 
 
 		 637 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 635 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  54.98 
 
 		 637 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  86.02 
 
 		 651 aa  1050    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  99.19 
 
 		 636 aa  1150    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  54.25 
 
 		 637 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  54.17 
 
 		 636 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  57.47 
 
 		 635 aa  678    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  86.34 
 
 		 636 aa  1045    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 635 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  87.8 
 
 		 636 aa  1046    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  81.37 
 
 		 636 aa  951    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  54.22 
 
 		 636 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 635 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  54.86 
 
 		 641 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 640 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.41 
 
 		 635 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 		 635 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 638 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 635 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  55.14 
 
 		 657 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 		 643 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  54.08 
 
 		 637 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 640 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  54.25 
 
 		 637 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  56.49 
 
 		 636 aa  697    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 634 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  56.77 
 
 		 633 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  82.54 
 
 		 633 aa  967    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 635 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  54.55 
 
 		 650 aa  656    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  55.48 
 
 		 636 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.63 
 
 		 639 aa  658    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 640 aa  664    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  57.9 
 
 		 644 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  100 
 
 		 615 aa  1240    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  59.09 
 
 		 636 aa  704    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  96.59 
 
 		 636 aa  1139    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  54.68 
 
 		 656 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  54.25 
 
 		 637 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  55.77 
 
 		 637 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  55.77 
 
 		 637 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  58.6 
 
 		 672 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  53.45 
 
 		 636 aa  640    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  54.31 
 
 		 639 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.45 
 
 		 637 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  82.76 
 
 		 638 aa  958    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  56.09 
 
 		 637 aa  685    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 637 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  55.45 
 
 		 637 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  53.38 
 
 		 640 aa  634  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  56.11 
 
 		 647 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  53.27 
 
 		 643 aa  628  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  55.39 
 
 		 643 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 650 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  54.5 
 
 		 635 aa  621  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  53.93 
 
 		 692 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  57.26 
 
 		 642 aa  619  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  53.77 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  52.78 
 
 		 635 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  52.91 
 
 		 657 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  49.07 
 
 		 664 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  54.11 
 
 		 676 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  53.18 
 
 		 650 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 		 646 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  54.01 
 
 		 646 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  53.69 
 
 		 646 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  52.88 
 
 		 650 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 646 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  54.27 
 
 		 643 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  54.43 
 
 		 643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  54.43 
 
 		 643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 639 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  54.43 
 
 		 643 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  52.86 
 
 		 634 aa  599  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  52.03 
 
 		 641 aa  601  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  48.23 
 
 		 672 aa  598  1e-170  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  53.04 
 
 		 646 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 646 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  54.11 
 
 		 628 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  48.75 
 
 		 663 aa  599  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  54.27 
 
 		 643 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  51.54 
 
 		 624 aa  571  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  47.63 
 
 		 616 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  47.46 
 
 		 616 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>