29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3230 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  39.77 
 
 		 452 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  41.56 
 
 		 455 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  43.06 
 
 		 482 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  33.8 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  45 
 
 		 406 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  38.57 
 
 		 422 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  40 
 
 		 449 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.45 
 
 		 365 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  35.71 
 
 		 423 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  36.62 
 
 		 440 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  47.83 
 
 		 647 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0003  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 		 382 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  0.393317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5034  hypothetical protein  42.86 
 
 		 572 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2264  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1157 aa  43.9  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  34.55 
 
 		 530 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5972  ABC transporter related  41.38 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  43.75 
 
 		 403 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.39 
 
 		 430 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0003  DNA replication and repair protein RecF  40.43 
 
 		 382 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0121  ATPase-like protein  45.24 
 
 		 407 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.188452 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  33.33 
 
 		 1202 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  25.81 
 
 		 368 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  25.81 
 
 		 369 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0003  recombination protein F  36.96 
 
 		 379 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0714428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.04 
 
 		 370 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0004  recombination protein F  36.96 
 
 		 378 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0005  DNA replication and repair protein RecF  38.81 
 
 		 412 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0464034  hitchhiker  1.0596299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  25.97 
 
 		 369 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>