72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1594 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2720  ATP-dependent OLD family endonuclease  64.44 
 
 		 552 aa  703    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2614  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1138    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1709  hypothetical protein  65.88 
 
 		 554 aa  749    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.137419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0980  hypothetical protein  64.44 
 
 		 552 aa  703    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0950  hypothetical protein  64.62 
 
 		 552 aa  704    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.714273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1668  hypothetical protein  75.63 
 
 		 554 aa  862    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413918  normal  0.886793 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2370  hypothetical protein  67.63 
 
 		 553 aa  753    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1594  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1138    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00887  hypothetical protein  64.44 
 
 		 552 aa  703    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2699  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1138    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2766  conserved hypothetical protein  64.44 
 
 		 552 aa  703    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2283  hypothetical protein  64.62 
 
 		 552 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0243665  normal  0.014671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2270  hypothetical protein  66.67 
 
 		 553 aa  730    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2452  hypothetical protein  64.62 
 
 		 552 aa  704    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.234891  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0974  conserved protein nucleotide triphosphate hydrolase domain  65.16 
 
 		 552 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.120281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1037  hypothetical protein  65.16 
 
 		 552 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1057  conserved protein, nucleotide triphosphate hydrolase domain protein  65.16 
 
 		 552 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0940  hypothetical protein  64.98 
 
 		 552 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1006  hypothetical protein  64.98 
 
 		 552 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1038  hypothetical protein  64.26 
 
 		 552 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1393  ATP-dependent OLD family endonuclease  63.9 
 
 		 552 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.175069 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00881  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  64.44 
 
 		 552 aa  703    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1975  hypothetical protein  65.88 
 
 		 554 aa  758    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.650483  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000190  ATP-dependent endonuclease  44.3 
 
 		 544 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0284428  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0477  hypothetical protein  44.77 
 
 		 543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000481423  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05915  hypothetical protein  44.28 
 
 		 544 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0449  hypothetical protein  42.99 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.380291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0201  ATP-dependent endonuclease of the OLD family protein  37.25 
 
 		 558 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.66 
 
 		 566 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.26 
 
 		 607 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  24.1 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.46 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.56 
 
 		 639 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  23.73 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  22 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  22.69 
 
 		 634 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3680  hypothetical protein  22.9 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228767  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.22 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  22.41 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  22.66 
 
 		 613 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  24.04 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3102  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.61 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  25.9 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  25.09 
 
 		 758 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2459  hypothetical protein  20.84 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.707067  normal  0.551867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  25.58 
 
 		 645 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  24.64 
 
 		 594 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.49 
 
 		 626 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  22.75 
 
 		 564 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  29.79 
 
 		 610 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  26.32 
 
 		 712 aa  51.2  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4276  Fis family transcriptional regulator  21.22 
 
 		 645 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.237058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  20.69 
 
 		 650 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  26.9 
 
 		 682 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  30.46 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  25.81 
 
 		 703 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.65 
 
 		 608 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  34.83 
 
 		 659 aa  49.3  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.76 
 
 		 640 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  36.47 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  23.44 
 
 		 604 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.29 
 
 		 615 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  26.04 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  40.82 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  24.61 
 
 		 707 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.34 
 
 		 674 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  35.37 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  32.03 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  37.66 
 
 		 598 aa  44.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.65 
 
 		 605 aa  43.9  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  42.22 
 
 		 619 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  21.65 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>