More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2444 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 553 aa  1090    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  95.12 
 
 		 553 aa  1009    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  62.23 
 
 		 554 aa  671    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  62.93 
 
 		 553 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  59.29 
 
 		 558 aa  627  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  57.71 
 
 		 556 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  50.27 
 
 		 554 aa  545  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 560 aa  422  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  40.7 
 
 		 577 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.85 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  38.85 
 
 		 566 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  41.87 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.22 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 		 583 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  38.57 
 
 		 579 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  38.57 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 559 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 559 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  38.96 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  40.6 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 561 aa  362  7.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 565 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.03 
 
 		 560 aa  361  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 605 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 562 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  38.53 
 
 		 559 aa  353  4e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  38.28 
 
 		 601 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  36.23 
 
 		 556 aa  350  5e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  36.93 
 
 		 569 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.62 
 
 		 599 aa  346  7e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.92 
 
 		 588 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  37.66 
 
 		 552 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  36.94 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 567 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 552 aa  340  4e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.84 
 
 		 559 aa  339  9e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  40.7 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  36.17 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 578 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 588 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.74 
 
 		 555 aa  333  6e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  37.55 
 
 		 553 aa  333  6e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 		 551 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 580 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.55 
 
 		 557 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  41.51 
 
 		 606 aa  330  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  38.92 
 
 		 558 aa  329  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  41.54 
 
 		 606 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.18 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  34.83 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  41.33 
 
 		 606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  36.78 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 		 559 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  37 
 
 		 553 aa  327  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 552 aa  326  6e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  36.78 
 
 		 553 aa  326  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 568 aa  326  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  36.78 
 
 		 553 aa  326  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  36.41 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  36 
 
 		 567 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  34.12 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  36.41 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.23 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  36.41 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  33.27 
 
 		 551 aa  324  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  36.23 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  36.23 
 
 		 553 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 558 aa  323  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 555 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.94 
 
 		 555 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  36.35 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  36.05 
 
 		 553 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  35.69 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.99 
 
 		 554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  35.69 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  35.69 
 
 		 553 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.74 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.46 
 
 		 553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 557 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>