More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0814 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 570 aa  1131    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  54.56 
 
 		 567 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  45.66 
 
 		 566 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  40.59 
 
 		 577 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  43.33 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  42.76 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  41.4 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  41.17 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  39.69 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  39.79 
 
 		 579 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  39.69 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 		 573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 		 579 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 583 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  39.62 
 
 		 583 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  39.62 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  40.03 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 559 aa  399  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.06 
 
 		 586 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  40.67 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 		 554 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  40.46 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  40.32 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 		 558 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  39.06 
 
 		 561 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  39.05 
 
 		 556 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  40.85 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  36.23 
 
 		 556 aa  372  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  37.74 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  39.54 
 
 		 572 aa  365  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 		 578 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  36.65 
 
 		 555 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.7 
 
 		 555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  35.58 
 
 		 555 aa  357  3.9999999999999996e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  35.73 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.72 
 
 		 588 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 588 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  37.17 
 
 		 560 aa  343  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 574 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 555 aa  339  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 560 aa  339  8e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 588 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 552 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 574 aa  330  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 560 aa  329  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  39.33 
 
 		 542 aa  322  8e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  35.04 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 558 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 558 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 567 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 574 aa  310  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.33 
 
 		 554 aa  310  5e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 557 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 568 aa  309  6.999999999999999e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.05 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 572 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 564 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 567 aa  306  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 554 aa  306  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 553 aa  306  9.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  32.34 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.74 
 
 		 552 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  35.97 
 
 		 568 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  32.34 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 556 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 611 aa  303  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.39 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.47 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.21 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>