More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0623 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 568 aa  1133    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  57.39 
 
 		 568 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  59.12 
 
 		 567 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  50.88 
 
 		 569 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  50.97 
 
 		 574 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  51.68 
 
 		 573 aa  505  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  49.47 
 
 		 568 aa  493  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  43.94 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 554 aa  333  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  37.26 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.58 
 
 		 574 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.97 
 
 		 570 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.63 
 
 		 567 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 572 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 573 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 555 aa  306  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 555 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 		 566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 579 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 580 aa  303  6.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.22 
 
 		 553 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 579 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 583 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.3 
 
 		 579 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 579 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.12 
 
 		 583 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 579 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 579 aa  299  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 560 aa  299  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 556 aa  296  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 562 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.92 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.39 
 
 		 555 aa  295  2e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  31.15 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.63 
 
 		 556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 601 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 567 aa  283  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  30.64 
 
 		 565 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  32.46 
 
 		 551 aa  282  9e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 587 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 589 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  36.18 
 
 		 599 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 558 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 550 aa  279  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 559 aa  279  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 557 aa  279  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  31.01 
 
 		 562 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 554 aa  276  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 558 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  32.63 
 
 		 569 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  33.79 
 
 		 576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  31.88 
 
 		 554 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  32.22 
 
 		 568 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 568 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 558 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 557 aa  269  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.21 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.49 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  30.14 
 
 		 555 aa  266  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  31.99 
 
 		 551 aa  266  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 606 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 		 567 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 606 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  30.62 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 558 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>