More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2499 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 561 aa  1130    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  39.06 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.09 
 
 		 577 aa  350  3e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.12 
 
 		 565 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 579 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 		 573 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 		 579 aa  339  7e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  35.54 
 
 		 583 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  36.12 
 
 		 551 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 579 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  38.34 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.61 
 
 		 556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.37 
 
 		 579 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 583 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  36 
 
 		 579 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 558 aa  329  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 574 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 572 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.05 
 
 		 580 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 552 aa  325  1e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.35 
 
 		 601 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 599 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 557 aa  320  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.15 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 582 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.49 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 		 587 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  32.8 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.57 
 
 		 555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 572 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 553 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.03 
 
 		 554 aa  300  7e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 572 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 559 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 569 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 560 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.81 
 
 		 608 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 555 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 578 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.81 
 
 		 556 aa  296  8e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 586 aa  295  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.92 
 
 		 588 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 595 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 552 aa  293  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 560 aa  292  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.53 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 574 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.96 
 
 		 605 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 575 aa  290  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 542 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.15 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.15 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 574 aa  287  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  31.81 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 563 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 552 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.15 
 
 		 553 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.45 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  32.02 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.97 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.37 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 		 558 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 588 aa  283  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>