More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_923 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  94.22 
 
 		 588 aa  1122    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  100 
 
 		 588 aa  1193    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  89.12 
 
 		 588 aa  1059    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  37.1 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.24 
 
 		 566 aa  379  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.01 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.9 
 
 		 565 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 567 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.71 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 570 aa  346  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 587 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 573 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 580 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.51 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.85 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 554 aa  336  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.3 
 
 		 573 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.68 
 
 		 556 aa  335  1e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.77 
 
 		 579 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 579 aa  333  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.42 
 
 		 583 aa  333  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 579 aa  333  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 583 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.42 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 579 aa  331  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 557 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 553 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.91 
 
 		 558 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 552 aa  322  8e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 562 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 553 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  35.87 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.24 
 
 		 565 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.51 
 
 		 574 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 559 aa  310  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 556 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.66 
 
 		 560 aa  304  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 567 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 565 aa  300  7e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.03 
 
 		 605 aa  299  8e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 565 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.79 
 
 		 569 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 558 aa  297  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.83 
 
 		 560 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  32.23 
 
 		 562 aa  286  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 561 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  33.22 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  31.94 
 
 		 551 aa  283  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.96 
 
 		 558 aa  283  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  33.8 
 
 		 567 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.98 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.65 
 
 		 559 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  31.25 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  31.97 
 
 		 552 aa  276  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  32.36 
 
 		 575 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 552 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.05 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 556 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 581 aa  266  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 		 555 aa  264  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 579 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.11 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  31.24 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 		 582 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 592 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.28 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  31.88 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  31.88 
 
 		 553 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>