More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2482 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 584 aa  1103    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  57.17 
 
 		 567 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  58.04 
 
 		 575 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  57.24 
 
 		 569 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  53.45 
 
 		 580 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  53.28 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  55.77 
 
 		 580 aa  502  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  52.64 
 
 		 585 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  53.14 
 
 		 585 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  52.6 
 
 		 584 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  50.84 
 
 		 579 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  51.18 
 
 		 579 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  50.34 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  52.74 
 
 		 611 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  52.72 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  51.05 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  49.92 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  47.99 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  49.67 
 
 		 583 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  49.32 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  51.85 
 
 		 578 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  47.46 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  50.94 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  45.95 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  47.53 
 
 		 592 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  47.06 
 
 		 590 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  45 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  47.55 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  47.55 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  47.89 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.41 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  47.6 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  47.3 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  45.09 
 
 		 612 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.88 
 
 		 567 aa  336  7.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43.76 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 577 aa  319  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 573 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 573 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.29 
 
 		 555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 579 aa  300  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 594 aa  300  7e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  31.9 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  31.9 
 
 		 579 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  31.73 
 
 		 583 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 555 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31.94 
 
 		 583 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 579 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 561 aa  296  8e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.64 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.02 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.77 
 
 		 562 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.31 
 
 		 580 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 559 aa  289  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.79 
 
 		 566 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.91 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 588 aa  287  5e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.17 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 		 588 aa  286  7e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.28 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.16 
 
 		 565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 574 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  41.1 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.61 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 554 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 		 572 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.8 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.93 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.84 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.58 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.53 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.71 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  40.17 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 559 aa  277  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.84 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.59 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 558 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 557 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.58 
 
 		 553 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.95 
 
 		 557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.75 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  31.54 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>