More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3025 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  72.15 
 
 		 580 aa  673    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  82.45 
 
 		 567 aa  880    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  69.61 
 
 		 570 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 569 aa  1091    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  72.79 
 
 		 575 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  58.41 
 
 		 580 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  56.85 
 
 		 584 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  57.24 
 
 		 584 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  55.04 
 
 		 583 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  55.79 
 
 		 611 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  54.95 
 
 		 585 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.93 
 
 		 592 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  54.36 
 
 		 585 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  55.27 
 
 		 583 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  52.56 
 
 		 593 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  51.31 
 
 		 579 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  50.6 
 
 		 579 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  51.05 
 
 		 577 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  51.92 
 
 		 574 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  56.97 
 
 		 610 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  52.15 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  53.19 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  52.35 
 
 		 578 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  49.83 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  46.71 
 
 		 590 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  50.95 
 
 		 580 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  47.44 
 
 		 591 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  46.08 
 
 		 598 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  45.88 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  47.8 
 
 		 590 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  46.38 
 
 		 588 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  47.8 
 
 		 590 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  47.88 
 
 		 587 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  47.36 
 
 		 612 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  36.6 
 
 		 577 aa  355  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  44.12 
 
 		 590 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.64 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 		 562 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.93 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 567 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 565 aa  317  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.52 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.66 
 
 		 556 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 570 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.25 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  34.17 
 
 		 608 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 556 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.76 
 
 		 554 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 		 553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 559 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.56 
 
 		 553 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.29 
 
 		 608 aa  303  8.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 580 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 553 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  31.54 
 
 		 579 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.6 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.7 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  31.08 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 559 aa  295  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 555 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.43 
 
 		 556 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 		 559 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.02 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 579 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.73 
 
 		 583 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 556 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  33.81 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.98 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.99 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.62 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.19 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 560 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.79 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 558 aa  286  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>