More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1126 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 577 aa  1118    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  59.86 
 
 		 583 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  56.53 
 
 		 574 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  56.57 
 
 		 578 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  52.17 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  52.6 
 
 		 575 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 579 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  51.05 
 
 		 569 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  48.31 
 
 		 585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  48.87 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  48.65 
 
 		 585 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  50.09 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  46.61 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  49.22 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  46.99 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  46.46 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  47.99 
 
 		 584 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  46.55 
 
 		 583 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  47.59 
 
 		 592 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  48.35 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  46.04 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.63 
 
 		 587 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  44.8 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  46.17 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  44.48 
 
 		 590 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  46 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  44.46 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.52 
 
 		 598 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  44.46 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  44.46 
 
 		 590 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  47.04 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  44.03 
 
 		 588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.84 
 
 		 590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.6 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  34.91 
 
 		 594 aa  299  9e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.69 
 
 		 566 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.36 
 
 		 573 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.18 
 
 		 567 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 565 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  41.21 
 
 		 557 aa  273  6e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.23 
 
 		 556 aa  273  7e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 		 562 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.28 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.3 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 		 579 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.67 
 
 		 570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.07 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.07 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  31.43 
 
 		 560 aa  267  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.71 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  27.49 
 
 		 565 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.24 
 
 		 552 aa  266  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 579 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.71 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.35 
 
 		 555 aa  265  1e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.29 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.54 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.54 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.09 
 
 		 556 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.54 
 
 		 579 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.66 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 558 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 		 555 aa  263  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  26.96 
 
 		 574 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  26.99 
 
 		 562 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.32 
 
 		 579 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  30.33 
 
 		 550 aa  263  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 556 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  27.67 
 
 		 558 aa  262  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.64 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.55 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  31.06 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33.11 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.25 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 568 aa  257  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.96 
 
 		 559 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  30.89 
 
 		 552 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.14 
 
 		 559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  30.72 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  35.9 
 
 		 567 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 554 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 568 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 549 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  28.57 
 
 		 561 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  29.84 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  30.61 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  30.61 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  30.61 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  30.61 
 
 		 552 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>