More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2032 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  74.96 
 
 		 575 aa  773    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  82.45 
 
 		 569 aa  861    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  70.97 
 
 		 570 aa  750    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 567 aa  1091    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  72.88 
 
 		 580 aa  691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  62.07 
 
 		 580 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  57.17 
 
 		 584 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  56.06 
 
 		 584 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  54.87 
 
 		 583 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  54.51 
 
 		 585 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  55.23 
 
 		 585 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  55.11 
 
 		 592 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  54.01 
 
 		 611 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  52.07 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  52.81 
 
 		 579 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  52.67 
 
 		 593 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  55.11 
 
 		 583 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  52.17 
 
 		 577 aa  500  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  54.8 
 
 		 592 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  53.16 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  56.97 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  52.25 
 
 		 583 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  53.85 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  50.6 
 
 		 580 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  47.51 
 
 		 588 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  48.2 
 
 		 590 aa  412  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  47.31 
 
 		 590 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  45.55 
 
 		 587 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  48.05 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  48.05 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  48.13 
 
 		 587 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.98 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  46.59 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  46.28 
 
 		 612 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.87 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  45.14 
 
 		 590 aa  360  5e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 567 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 		 562 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.43 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 580 aa  326  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 565 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 570 aa  324  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.98 
 
 		 559 aa  323  5e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 594 aa  322  9.999999999999999e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 		 565 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 579 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.53 
 
 		 573 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.64 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.3 
 
 		 583 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.67 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 553 aa  309  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.17 
 
 		 554 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 		 553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 555 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 		 561 aa  300  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 553 aa  300  7e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.24 
 
 		 574 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.45 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 552 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.92 
 
 		 574 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  296  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 556 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  27.66 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 552 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.79 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  39.47 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 552 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  27.84 
 
 		 565 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.08 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.26 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 552 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 557 aa  293  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.09 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>