More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13670 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 590 aa  1122    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  45.82 
 
 		 575 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  45.6 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  43.67 
 
 		 570 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  43.56 
 
 		 580 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  44.86 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  44.81 
 
 		 574 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  42.61 
 
 		 579 aa  355  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  44.06 
 
 		 569 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  42.69 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  45.64 
 
 		 592 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  42 
 
 		 593 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  41.81 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  42.54 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  43.99 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 578 aa  343  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  44.35 
 
 		 583 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  41.19 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  43.76 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  41.11 
 
 		 583 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  42.49 
 
 		 592 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  42.42 
 
 		 585 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  44.5 
 
 		 580 aa  326  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  41.35 
 
 		 590 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  42.79 
 
 		 590 aa  319  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  42.45 
 
 		 591 aa  317  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  41.2 
 
 		 587 aa  317  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  43.15 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  40.48 
 
 		 583 aa  309  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  39.61 
 
 		 598 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  41.19 
 
 		 590 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  41.19 
 
 		 590 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  41.65 
 
 		 587 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12390  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 		 651 aa  280  7e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00374737  normal  0.634901 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  32.89 
 
 		 594 aa  278  3e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.96 
 
 		 567 aa  277  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  36 
 
 		 608 aa  274  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  30.51 
 
 		 555 aa  274  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  40.94 
 
 		 612 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.77 
 
 		 566 aa  266  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  37.74 
 
 		 556 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  38.88 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 		 558 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.81 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.41 
 
 		 574 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.66 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.93 
 
 		 608 aa  257  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 556 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 559 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 561 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 		 556 aa  249  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 553 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 		 574 aa  249  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.3 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  30.11 
 
 		 553 aa  248  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 557 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  29.49 
 
 		 555 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 560 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 555 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.93 
 
 		 570 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 553 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.11 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  27.75 
 
 		 551 aa  244  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  28.97 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.88 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.58 
 
 		 554 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  31.11 
 
 		 553 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 589 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  240  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.76 
 
 		 553 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.76 
 
 		 553 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.46 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  35 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  31.75 
 
 		 553 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.29 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 555 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  31.63 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  30.58 
 
 		 553 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  31.99 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 559 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  36.44 
 
 		 557 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 554 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>