More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5429 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  62.07 
 
 		 567 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  61.49 
 
 		 570 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 580 aa  1117    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  65.52 
 
 		 575 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  63.67 
 
 		 580 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  58.97 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  55.52 
 
 		 584 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  55.36 
 
 		 583 aa  545  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  53.11 
 
 		 593 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  53.97 
 
 		 584 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  53.73 
 
 		 585 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.48 
 
 		 592 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  52.2 
 
 		 585 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  54.53 
 
 		 583 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  48.9 
 
 		 579 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  48.53 
 
 		 579 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  49.15 
 
 		 577 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  48.66 
 
 		 583 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  49.4 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 		 574 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  51.98 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  48.35 
 
 		 588 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  50.34 
 
 		 578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  45.97 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  47.88 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  43.88 
 
 		 590 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  45.58 
 
 		 591 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  44.41 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.11 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  44.63 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  44.63 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  44.71 
 
 		 587 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  43.73 
 
 		 590 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 577 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 594 aa  340  4e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  44.78 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 573 aa  331  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.2 
 
 		 608 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12390  DNA repair protein RecN  39.34 
 
 		 651 aa  306  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00374737  normal  0.634901 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 		 579 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.78 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.22 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.03 
 
 		 580 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  31.99 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 579 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.57 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 583 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.31 
 
 		 583 aa  291  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.41 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 579 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.63 
 
 		 553 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  30.31 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.56 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.14 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.14 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 559 aa  288  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 		 605 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.92 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.92 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.9 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.94 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.51 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.46 
 
 		 556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.35 
 
 		 561 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.7 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  33.56 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.29 
 
 		 552 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.46 
 
 		 552 aa  282  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.17 
 
 		 552 aa  283  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  31.7 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.57 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 559 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 556 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>