More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1913 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 585 aa  1117    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  94.18 
 
 		 585 aa  1037    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  66.32 
 
 		 583 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  60.18 
 
 		 592 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  56.73 
 
 		 593 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  57.99 
 
 		 575 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  55.23 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  54.36 
 
 		 570 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  53.49 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  58.49 
 
 		 610 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  56.7 
 
 		 580 aa  510  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  54.36 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  53.48 
 
 		 584 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  53.59 
 
 		 583 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  50.08 
 
 		 590 aa  491  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  52.97 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  49.49 
 
 		 579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  49.41 
 
 		 579 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  52.78 
 
 		 574 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  48.65 
 
 		 577 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  50 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  50.26 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  50 
 
 		 587 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  49.74 
 
 		 590 aa  448  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  50.25 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  50.51 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  50.25 
 
 		 590 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  51.79 
 
 		 611 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 592 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  50.68 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  47.11 
 
 		 583 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  47.07 
 
 		 580 aa  372  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  47.04 
 
 		 612 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 577 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.19 
 
 		 590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 562 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 573 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.57 
 
 		 567 aa  301  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 573 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.32 
 
 		 589 aa  298  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  297  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.39 
 
 		 553 aa  297  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.06 
 
 		 553 aa  297  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.62 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 553 aa  296  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  39.38 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  293  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  32.93 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.62 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.58 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 559 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 554 aa  286  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  39.17 
 
 		 529 aa  286  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  33.83 
 
 		 594 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.2 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.2 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.7 
 
 		 559 aa  283  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 		 579 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.76 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.87 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.87 
 
 		 579 aa  280  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 572 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.87 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.13 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 561 aa  279  8e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  29.87 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 553 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  31.72 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 554 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.76 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  39.9 
 
 		 557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 		 556 aa  273  6e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.26 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.57 
 
 		 566 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>