More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1245 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 592 aa  1141    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  54.8 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  54.31 
 
 		 575 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  52.22 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  55.94 
 
 		 580 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  53.19 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  49.23 
 
 		 585 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  49.4 
 
 		 580 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  50.17 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  47.4 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 579 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  48.35 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  49.65 
 
 		 574 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  48.07 
 
 		 584 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  47.17 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  50.87 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  47.58 
 
 		 584 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  46.31 
 
 		 583 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  45.58 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  46.76 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  46.83 
 
 		 592 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  46.02 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  45.3 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  45.3 
 
 		 590 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  45.71 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  47.27 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  44.52 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  43.29 
 
 		 590 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  43.52 
 
 		 590 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  44.56 
 
 		 587 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  45.12 
 
 		 590 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  45.38 
 
 		 612 aa  353  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  44.2 
 
 		 591 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  43.79 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 559 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.77 
 
 		 562 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  31.58 
 
 		 567 aa  325  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.72 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 577 aa  316  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.07 
 
 		 573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 		 586 aa  306  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  36.75 
 
 		 599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.76 
 
 		 554 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 		 567 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 561 aa  303  7.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  37.29 
 
 		 601 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.09 
 
 		 566 aa  302  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 559 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  31.02 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  31.24 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.95 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.02 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 583 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  30.9 
 
 		 583 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 555 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.48 
 
 		 555 aa  293  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  30.9 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 565 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  36.23 
 
 		 554 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  29.5 
 
 		 555 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  40.5 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.96 
 
 		 561 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 555 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  34.05 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  33.22 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.11 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.44 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 572 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 594 aa  281  3e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.27 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.68 
 
 		 554 aa  280  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  33.99 
 
 		 553 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  280  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  32.45 
 
 		 554 aa  280  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.18 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  31.84 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>