More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2964 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11711  DNA repair protein recN  70.77 
 
 		 587 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.31285  normal  0.395213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3507  DNA repair protein RecN  77.35 
 
 		 598 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0691312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2964  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 587 aa  1120    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2949  DNA repair protein RecN  98.64 
 
 		 590 aa  1049    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2993  DNA repair protein RecN  98.64 
 
 		 590 aa  1049    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311205  normal  0.473383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3288  DNA repair protein RecN  78.29 
 
 		 591 aa  847    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2381  DNA repair protein RecN  58.26 
 
 		 590 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  56.31 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2826  DNA repair protein RecN  53.79 
 
 		 590 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5439  DNA repair protein RecN  54.53 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  50.85 
 
 		 585 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  50.51 
 
 		 585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4072  DNA repair protein RecN  49.92 
 
 		 588 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367674  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4437  DNA repair protein RecN  51.02 
 
 		 583 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297367  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  48.9 
 
 		 570 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  48.13 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  48.4 
 
 		 574 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  48.13 
 
 		 575 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3010  DNA repair protein RecN  51.53 
 
 		 610 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  46.92 
 
 		 584 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  45.15 
 
 		 577 aa  391  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  47.88 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  48.61 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22130  DNA replication and repair protein RecN  46.93 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  47.29 
 
 		 584 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  44.52 
 
 		 580 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  44.33 
 
 		 579 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  44.46 
 
 		 579 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1753  DNA repair protein RecN  45.77 
 
 		 583 aa  364  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391848  hitchhiker  0.000930146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3147  DNA repair protein RecN  45.03 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041532  normal  0.691504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  46.98 
 
 		 578 aa  353  5e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 		 592 aa  350  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14210  DNA repair protein RecN  45.21 
 
 		 580 aa  345  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0453265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2355  DNA repair protein RecN  42.97 
 
 		 612 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.887863  hitchhiker  0.00822868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.11 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0681  DNA repair protein RecN  35.67 
 
 		 594 aa  293  6e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13670  DNA repair protein RecN  41.68 
 
 		 590 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.325794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.74 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0793  DNA repair ATPase  38.08 
 
 		 608 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 		 523 aa  273  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  30.97 
 
 		 561 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 559 aa  271  4e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 		 554 aa  269  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.83 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.88 
 
 		 577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.19 
 
 		 567 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 566 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.62 
 
 		 555 aa  261  3e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  29.88 
 
 		 579 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.9 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 529 aa  258  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 		 579 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  29.1 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 		 579 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  29.1 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  29.1 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.93 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  29.1 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  29.71 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.3 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 557 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  30.64 
 
 		 552 aa  253  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2491  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 		 571 aa  251  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.7 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  34.1 
 
 		 549 aa  251  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  27.41 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 591 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  30.05 
 
 		 569 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 578 aa  246  8e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 549 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.95 
 
 		 608 aa  246  9e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  28.23 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.31 
 
 		 565 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  35.82 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  28.23 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.33 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.05 
 
 		 589 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  30.19 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.47 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  29.95 
 
 		 556 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  30.19 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 549 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.15 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  30.02 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  30.02 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  37.65 
 
 		 556 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  30.02 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.19 
 
 		 554 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  30.02 
 
 		 553 aa  244  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  29.59 
 
 		 562 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 553 aa  243  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>