More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3497 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 553 aa  1078    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  69.08 
 
 		 554 aa  687    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  61.43 
 
 		 561 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  63.96 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  62.62 
 
 		 557 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  60.89 
 
 		 561 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  62.75 
 
 		 562 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  60.46 
 
 		 561 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  62.1 
 
 		 561 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  58.76 
 
 		 565 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  62.46 
 
 		 561 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  60.5 
 
 		 557 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  61.23 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  63.49 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  61.41 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  61.52 
 
 		 565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  57.67 
 
 		 559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  57.67 
 
 		 559 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  57.3 
 
 		 554 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  57.54 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  57.35 
 
 		 557 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  57.54 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  56.09 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  57.61 
 
 		 558 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  51.45 
 
 		 555 aa  521  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  55.04 
 
 		 557 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  48.84 
 
 		 554 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.64 
 
 		 577 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.15 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.15 
 
 		 546 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  48.84 
 
 		 553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48.52 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.49 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  44.81 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  45.74 
 
 		 565 aa  375  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  47.23 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  49.73 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  46.71 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.16 
 
 		 552 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  43.93 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.75 
 
 		 589 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.76 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 558 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.87 
 
 		 556 aa  307  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 558 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 559 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  37.79 
 
 		 569 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  37.34 
 
 		 591 aa  302  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.58 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  38.02 
 
 		 549 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  37.25 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 		 559 aa  301  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 		 557 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 549 aa  300  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  35.48 
 
 		 557 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  38.2 
 
 		 549 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 568 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 549 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 564 aa  297  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.28 
 
 		 579 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.62 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  37.99 
 
 		 549 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 557 aa  296  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  37.57 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.93 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.93 
 
 		 583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 554 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 557 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  35.78 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  36.54 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>