More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3096 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 574 aa  1143    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  44.82 
 
 		 554 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  44.01 
 
 		 558 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  44.15 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  41.39 
 
 		 572 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  42.76 
 
 		 554 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  41.04 
 
 		 560 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  41.94 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  40.49 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.65 
 
 		 560 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 601 aa  364  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 		 599 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  41.87 
 
 		 553 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 569 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  38.37 
 
 		 605 aa  362  8e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  37.46 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  37.46 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  37.46 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 556 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  37.28 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  37.28 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  37.1 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  37.28 
 
 		 553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  36.92 
 
 		 553 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  37.52 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  36.69 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  38.21 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  36.69 
 
 		 553 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  36.51 
 
 		 553 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 573 aa  349  8e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 573 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 		 563 aa  346  8e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.91 
 
 		 555 aa  346  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  36.79 
 
 		 552 aa  346  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.69 
 
 		 554 aa  342  8e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  36.43 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  36.61 
 
 		 552 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  34.88 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  37.17 
 
 		 567 aa  342  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 		 580 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  36.61 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 570 aa  340  4e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 567 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  37.23 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 		 555 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  36.07 
 
 		 552 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 		 565 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  37.48 
 
 		 554 aa  339  7e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 		 559 aa  339  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 611 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  36.54 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  36.54 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  36.36 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  36.54 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  36.54 
 
 		 552 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  35.89 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  36.15 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  35.89 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  35.89 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  36.45 
 
 		 553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  35.7 
 
 		 553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 579 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  35.48 
 
 		 553 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 		 568 aa  336  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  35.97 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  38.09 
 
 		 574 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 579 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 549 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 583 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  36.61 
 
 		 553 aa  333  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 549 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  35.03 
 
 		 583 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 586 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 579 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.03 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.85 
 
 		 579 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.85 
 
 		 579 aa  330  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.47 
 
 		 552 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  36.88 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>