More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3397 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  60.82 
 
 		 601 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  61 
 
 		 599 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 586 aa  1174    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  55.94 
 
 		 587 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.17 
 
 		 577 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  38.06 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.07 
 
 		 566 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 567 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  39.42 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  39.42 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  39.42 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  39.42 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  39.25 
 
 		 583 aa  379  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 		 562 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.84 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 579 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  40.55 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 579 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.84 
 
 		 554 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.31 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.67 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 580 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 557 aa  363  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 555 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.93 
 
 		 588 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 588 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 588 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  37.41 
 
 		 555 aa  353  5e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 		 554 aa  353  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 565 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 565 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 565 aa  349  6e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 553 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  38.71 
 
 		 560 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  37.72 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  37.75 
 
 		 559 aa  339  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  37.22 
 
 		 572 aa  339  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.98 
 
 		 556 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 565 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  39.33 
 
 		 578 aa  337  5e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.9 
 
 		 552 aa  333  6e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.79 
 
 		 556 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.96 
 
 		 555 aa  326  8.000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 558 aa  323  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.02 
 
 		 560 aa  322  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  37.11 
 
 		 560 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  36 
 
 		 562 aa  320  5e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  38.22 
 
 		 553 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 559 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 559 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.83 
 
 		 572 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  37.73 
 
 		 556 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.68 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.85 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.68 
 
 		 552 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  39.53 
 
 		 572 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  34.5 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.85 
 
 		 554 aa  306  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 552 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 553 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.33 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 564 aa  300  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.74 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  35.34 
 
 		 567 aa  297  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 556 aa  297  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 582 aa  296  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.41 
 
 		 573 aa  294  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 561 aa  294  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 555 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 559 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  36.78 
 
 		 551 aa  293  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.92 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.87 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 554 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  37.01 
 
 		 592 aa  290  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.02 
 
 		 557 aa  290  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  34.9 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  34.9 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.9 
 
 		 553 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 		 563 aa  289  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  34.9 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>