More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0370 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 578 aa  1138    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  46.48 
 
 		 574 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  44.83 
 
 		 567 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  43.56 
 
 		 569 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  42.33 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  43.94 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  45.15 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  43.76 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 577 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  38.99 
 
 		 572 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  40.24 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  40.49 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  37.25 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 573 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.51 
 
 		 599 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.67 
 
 		 573 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 		 554 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  36.71 
 
 		 588 aa  356  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  35.62 
 
 		 566 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.88 
 
 		 588 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 555 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.22 
 
 		 560 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 558 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.61 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  39.29 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 559 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 559 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.96 
 
 		 557 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 579 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.99 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.82 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  35.85 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 579 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 574 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  35.22 
 
 		 567 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 		 560 aa  341  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 587 aa  340  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.98 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 588 aa  333  5e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 555 aa  333  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.79 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 565 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 565 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.47 
 
 		 553 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 557 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  34.86 
 
 		 553 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 611 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  34.86 
 
 		 553 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  34.86 
 
 		 553 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 580 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.2 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 552 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 550 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 567 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  36.67 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 552 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 		 565 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  36.19 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  37.26 
 
 		 569 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  36.49 
 
 		 549 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 556 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.44 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 549 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 549 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  34.38 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 549 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.91 
 
 		 559 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.04 
 
 		 558 aa  314  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 		 549 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  36.14 
 
 		 549 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 549 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  34.92 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.39 
 
 		 553 aa  309  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.67 
 
 		 554 aa  309  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.21 
 
 		 552 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>