More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1612 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  100 
 
 
573 aa  1146    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  55.22 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  48.62 
 
 
568 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  51.91 
 
 
574 aa  529  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  51.68 
 
 
568 aa  521  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  46.37 
 
 
569 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  47.43 
 
 
568 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  44.27 
 
 
578 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 
574 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.85 
 
 
577 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  36.61 
 
 
573 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.59 
 
 
560 aa  323  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  36.36 
 
 
579 aa  320  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 
573 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.89 
 
 
558 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 
587 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 
579 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 
579 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  35.27 
 
 
579 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  35.81 
 
 
579 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  35.34 
 
 
565 aa  317  4e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 
583 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  35.64 
 
 
583 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 
567 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 
574 aa  313  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  36.54 
 
 
555 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  35.04 
 
 
552 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  35.63 
 
 
601 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  37.24 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
566 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 
586 aa  309  8e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 
570 aa  309  8e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.5 
 
 
554 aa  309  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  36.36 
 
 
553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  36.19 
 
 
553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 
565 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  36.19 
 
 
553 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  36.19 
 
 
553 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  36.08 
 
 
553 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  36.19 
 
 
553 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
554 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.95 
 
 
556 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 
559 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 
572 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 
562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 
589 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 
557 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 
576 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  34.85 
 
 
556 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.34 
 
 
554 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  34.34 
 
 
552 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  34.34 
 
 
552 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  34.16 
 
 
552 aa  301  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 
552 aa  300  5e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.96 
 
 
554 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 
556 aa  300  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 
559 aa  299  9e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 
554 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 
559 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.68 
 
 
556 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 
588 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 
567 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 
599 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  34.69 
 
 
552 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 
553 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.68 
 
 
588 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  35.14 
 
 
553 aa  297  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  297  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  35.61 
 
 
553 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 
588 aa  296  5e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 
555 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  34.69 
 
 
552 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  296  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  34.69 
 
 
552 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  34.69 
 
 
552 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  36.13 
 
 
553 aa  296  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  34.69 
 
 
552 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  34.97 
 
 
553 aa  296  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.98 
 
 
572 aa  295  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  35.14 
 
 
553 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
565 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 
565 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 
557 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.08 
 
 
558 aa  293  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 
557 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.82 
 
 
557 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 
549 aa  293  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.57 
 
 
552 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.39 
 
 
555 aa  293  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.08 
 
 
562 aa  293  8e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  35.71 
 
 
557 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 
557 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.87 
 
 
553 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.97 
 
 
554 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>