More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2071 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  79.41 
 
 		 557 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  81.47 
 
 		 557 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  69.8 
 
 		 559 aa  705    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  81.47 
 
 		 557 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  68.22 
 
 		 558 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  68.69 
 
 		 554 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1098    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  69.8 
 
 		 559 aa  706    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  59.57 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  58.54 
 
 		 565 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  59.93 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  60.29 
 
 		 562 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  59.41 
 
 		 557 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  60.04 
 
 		 561 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  59.14 
 
 		 561 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  59.49 
 
 		 557 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  58.42 
 
 		 561 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  58.06 
 
 		 561 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  59.68 
 
 		 561 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  56.6 
 
 		 553 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  59.04 
 
 		 557 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  58.33 
 
 		 566 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  58.51 
 
 		 566 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  57.09 
 
 		 554 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  58.08 
 
 		 565 aa  555  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  52.78 
 
 		 557 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  47.58 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  47.12 
 
 		 570 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  49.1 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.22 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  46.7 
 
 		 546 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  46.89 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.33 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  47.17 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  43.6 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  45.79 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  46.52 
 
 		 546 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  46.11 
 
 		 547 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  46.34 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 		 559 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  39.36 
 
 		 552 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  48.75 
 
 		 556 aa  359  9e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  43.62 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.87 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.35 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  38.74 
 
 		 557 aa  334  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  40.25 
 
 		 576 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 558 aa  329  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  35.52 
 
 		 557 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  38.94 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 554 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 557 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  34.4 
 
 		 554 aa  316  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  37.03 
 
 		 554 aa  316  7e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 558 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 553 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.18 
 
 		 557 aa  313  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.98 
 
 		 553 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.78 
 
 		 554 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  32.68 
 
 		 555 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.88 
 
 		 553 aa  311  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  34.7 
 
 		 552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 554 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.9 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 567 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.6 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 552 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.55 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.87 
 
 		 552 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 554 aa  306  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.53 
 
 		 553 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  38.39 
 
 		 549 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  35.35 
 
 		 552 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  35.17 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  37.85 
 
 		 568 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  32.51 
 
 		 555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.85 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  36.04 
 
 		 563 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.38 
 
 		 565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  38.76 
 
 		 573 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>