More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0537 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 568 aa  1142    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  58.02 
 
 		 569 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  54.27 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  52.82 
 
 		 568 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  52.02 
 
 		 574 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  49.47 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  47.43 
 
 		 573 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  45.15 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 577 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.32 
 
 		 567 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 574 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 558 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 570 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 579 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  34.89 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 579 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 554 aa  323  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 579 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.17 
 
 		 572 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  34.54 
 
 		 583 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.37 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 573 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  31.81 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.98 
 
 		 573 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 565 aa  316  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 559 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.16 
 
 		 556 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 554 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 		 564 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 		 551 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 601 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 553 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 566 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  34.16 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.92 
 
 		 567 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  35.15 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  35.34 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 555 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.98 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.15 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  32 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.93 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.34 
 
 		 558 aa  293  8e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.77 
 
 		 588 aa  292  9e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.8 
 
 		 556 aa  292  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.81 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 		 562 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 559 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 560 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.25 
 
 		 587 aa  287  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 558 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  34.37 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  34.37 
 
 		 553 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  34.37 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.98 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.98 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 549 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 591 aa  283  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 552 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  32.34 
 
 		 555 aa  283  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.75 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.75 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.28 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  34.54 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.22 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  34.54 
 
 		 553 aa  280  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  34.28 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 558 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 		 589 aa  279  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  31.62 
 
 		 551 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  34.36 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.36 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>