More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0877 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 552 aa  1119    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.87 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2819  DNA repair protein RecN  38.63 
 
 		 553 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  hitchhiker  0.00282125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 558 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 565 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 		 557 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.79 
 
 		 558 aa  306  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 562 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.09 
 
 		 569 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 553 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 559 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 559 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 		 556 aa  302  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 578 aa  300  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.9 
 
 		 566 aa  297  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  36.13 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.83 
 
 		 556 aa  294  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.13 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.18 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.18 
 
 		 556 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.62 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.23 
 
 		 565 aa  291  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.03 
 
 		 567 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 558 aa  286  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  32.02 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  34.19 
 
 		 557 aa  283  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 		 560 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.85 
 
 		 555 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  36.15 
 
 		 559 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  30.85 
 
 		 555 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 555 aa  276  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  32.12 
 
 		 561 aa  276  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  31.65 
 
 		 552 aa  276  9e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  35.97 
 
 		 559 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.97 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.89 
 
 		 555 aa  276  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 567 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 559 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  32.54 
 
 		 557 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 567 aa  273  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.8 
 
 		 570 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  34.54 
 
 		 554 aa  273  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 561 aa  272  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  35.04 
 
 		 556 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  30.25 
 
 		 550 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  33.46 
 
 		 560 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.32 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.24 
 
 		 565 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.06 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.16 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.98 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 559 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.65 
 
 		 554 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 		 599 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 568 aa  266  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  32.49 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 574 aa  265  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  32.72 
 
 		 557 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 		 563 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.65 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  31.17 
 
 		 551 aa  264  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  31.76 
 
 		 572 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  34.39 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  31.58 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 572 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  31.42 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.93 
 
 		 605 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 601 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  31.55 
 
 		 557 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 559 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  30.67 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  31.29 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  34.64 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>