More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1031 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 572 aa  1123    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 565 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  43.81 
 
 		 562 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  42.58 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  39.36 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  38.99 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 573 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 557 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  40.31 
 
 		 577 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  40.14 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  41.68 
 
 		 554 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  41.47 
 
 		 554 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 579 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  36.73 
 
 		 579 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 579 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 579 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 583 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  36.56 
 
 		 583 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 579 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  36.73 
 
 		 579 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  43.68 
 
 		 551 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  36.56 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 		 558 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  36.91 
 
 		 579 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  39.93 
 
 		 560 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 558 aa  342  9e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.69 
 
 		 556 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  38.54 
 
 		 601 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 		 561 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.87 
 
 		 580 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 		 558 aa  336  7e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  39.64 
 
 		 586 aa  336  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  40.07 
 
 		 556 aa  333  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 		 552 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  41.13 
 
 		 553 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.55 
 
 		 555 aa  329  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 553 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.93 
 
 		 562 aa  327  5e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 553 aa  326  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 		 572 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  39.32 
 
 		 574 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 559 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 559 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 559 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 565 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  38.49 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 557 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 559 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 587 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.78 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 560 aa  306  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 595 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 586 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 582 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 		 563 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.59 
 
 		 588 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.61 
 
 		 557 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  32.68 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  35.4 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  35.79 
 
 		 552 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.54 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  36.65 
 
 		 568 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  34.46 
 
 		 575 aa  293  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.74 
 
 		 578 aa  290  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 561 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.99 
 
 		 559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  32.79 
 
 		 551 aa  283  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 569 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 556 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 579 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 558 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0036  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.48 
 
 		 564 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  29.96 
 
 		 608 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.02 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.26 
 
 		 567 aa  273  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>