More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1845 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1845  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 552 aa  1117    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  49.91 
 
 		 550 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09463  DNA repair protein RecN  46.81 
 
 		 550 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.070219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  41.17 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  39.45 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  39.93 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5209  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 551 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1849  DNA repair protein RecN  35.57 
 
 		 551 aa  342  7e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 558 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 557 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.1 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  32.27 
 
 		 552 aa  293  6e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 574 aa  290  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 567 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.79 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  34.07 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  31.65 
 
 		 552 aa  283  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.37 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  31.18 
 
 		 554 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  32.79 
 
 		 554 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  32.79 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  31.41 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.56 
 
 		 552 aa  280  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  31 
 
 		 554 aa  279  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 556 aa  279  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.5 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.07 
 
 		 556 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 557 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 		 565 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.38 
 
 		 552 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  32.38 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 		 557 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.38 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 		 567 aa  277  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 557 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  30.66 
 
 		 554 aa  276  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 552 aa  276  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  31 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.89 
 
 		 608 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.05 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  31.23 
 
 		 563 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  32.03 
 
 		 565 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  31.34 
 
 		 579 aa  274  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  31.48 
 
 		 556 aa  274  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  31.02 
 
 		 557 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  29.62 
 
 		 568 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  33.57 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  32.44 
 
 		 562 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  30.88 
 
 		 579 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  33.45 
 
 		 559 aa  273  5.000000000000001e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  31.29 
 
 		 558 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.63 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.44 
 
 		 552 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.21 
 
 		 570 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 		 568 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  31.13 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  30.18 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  29.98 
 
 		 569 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.69 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  30.4 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  31.47 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.41 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  32.97 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 565 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  30 
 
 		 549 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  29.01 
 
 		 557 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  30.73 
 
 		 556 aa  270  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.01 
 
 		 553 aa  269  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 		 573 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 547 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  30.99 
 
 		 579 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 557 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>