More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1453 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1046    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  37.65 
 
 		 573 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 573 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 566 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  44.74 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.85 
 
 		 572 aa  317  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1126  DNA repair protein RecN  41.21 
 
 		 577 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  34.11 
 
 		 557 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1517  DNA repair protein RecN  39.37 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000776355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 		 605 aa  310  5e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  41.31 
 
 		 575 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.27 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1342  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.85 
 
 		 579 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  39.83 
 
 		 585 aa  301  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 579 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  39.31 
 
 		 593 aa  300  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 579 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.82 
 
 		 579 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.92 
 
 		 560 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.64 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.49 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.97 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  32.82 
 
 		 579 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  40.43 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.64 
 
 		 583 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 567 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  35.85 
 
 		 588 aa  296  8e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.91 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  35.9 
 
 		 557 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  31.78 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.11 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  39.51 
 
 		 567 aa  294  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  37.68 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2482  DNA repair protein RecN  40.27 
 
 		 584 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  35.39 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 579 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 555 aa  289  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  38.41 
 
 		 558 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  37.92 
 
 		 557 aa  289  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 561 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.06 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.26 
 
 		 608 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 		 588 aa  289  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.9 
 
 		 558 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.86 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  39.19 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.88 
 
 		 558 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 556 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  39.22 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 554 aa  287  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  40.5 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 554 aa  286  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  36.75 
 
 		 552 aa  286  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 564 aa  286  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.75 
 
 		 563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  39.61 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  31.66 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1659  DNA repair protein RecN  41.92 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0674828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 		 554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  37.04 
 
 		 554 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  30.5 
 
 		 574 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.46 
 
 		 559 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 		 557 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.98 
 
 		 554 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 		 574 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  36.02 
 
 		 557 aa  282  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 		 567 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  36.51 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 558 aa  280  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.63 
 
 		 554 aa  280  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  38.05 
 
 		 557 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  30.63 
 
 		 551 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  31.26 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2096  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 559 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1652  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.08 
 
 		 559 aa  278  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0474  DNA repair protein RecN  34.63 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.51796 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  35.85 
 
 		 560 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.62 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 552 aa  276  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  33.27 
 
 		 561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.98 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>